美国食品药品管理局（FDA）在其网站的消费者警告栏目中对高压氧治疗发布警告：目前，尚无相关证据证明高压氧治疗(HBOT)在临床上对癌症、自闭症或糖尿病有治疗作用或对其有效。但从互联网快速搜索一下，你会发现有各种信息声称HBOT对这些疾病或其它疾病有此作用，然而，目前尚无HBOT器械获FDA批准用于以上疾病的治疗。
很显然，HBOT供应商承诺的HBOT治疗病症清单比较长，除了自闭症和脑瘫之外，还包括帕金森氏病、肝炎及多发性硬化症。当然，这些病症中没有一种病症是与人体组织缺氧有关，而给人体组织供氧是HBOT标明的唯一治疗用途。事实上，FDA批准HBOT用于13个特定的症状，所有这些症状均与帮助促进人体与氧接触有关。这其中包括HBOT用于一氧化碳中毒和因高温或火所导致的烧伤。
根据FDA的信息，HBOT与其它任何医疗干预一样存在风险，包括轻度反应（如耳压或鼻窦疼痛）和非常严重的不良反应（如瘫痪和栓塞）。氧气对火有助燃作用，这对于使用HBOT的任何人来说都意味着存有火灾风险，全球已有大约80例死亡事件与HBOT有关。除了这些风险，FDA提醒那些使用HBOT治疗自闭症、脑瘫、癌症或帕金森氏病的人们这是在浪费时间和金钱，并且很可能会延误接受有效治疗和干预的时机。
支持将HBOT作为自闭症的一种治疗方案的人争论说，对HBOT的争议是“政治的而非科学的。”但事实并非如此，除了与HBOT相关的风险之外，研究发现至少包括疼痛和不舒服在内的症状，使用HBOT治疗是无效的。同时，这种只是试试看的、未批准的“标签外使用的”干预治疗是相当昂贵的。
一项2012年的评价HBOT治疗自闭症的回顾性研究表明，虽然HBOT治疗自闭症存在某些效果，但这种效果不能重复。回顾性研究的作者呼吁进行一项HBOT干预治疗的安慰剂对照临床试验。这样的研究几个月后也已出现。研究作者比较了HBOT与“虚假空气”的疗效，发现对照组和治疗组患者病症都没有得到改善，两组之间的结果没有明显差异。FDA报道，在过去三年内已收到27项投诉，称HBOT中心为没有获得FDA批准的病症提供HBOT“治疗”。
